MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_211

Total Repeats: 3099

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010660	GCGA	2	8	256	263	25 %	0 %	50 %	25 %	187734302
2	NC_010660	TGC	2	6	326	331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734302
3	NC_010660	CT	3	6	393	398	0 %	50 %	0 %	50 %	187734302
4	NC_010660	CCG	2	6	427	432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734302
5	NC_010660	TTC	2	6	435	440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734302
6	NC_010660	CCACT	2	10	512	521	20 %	20 %	0 %	60 %	187734302
7	NC_010660	GAC	2	6	525	530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734302
8	NC_010660	GCG	2	6	548	553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734302
9	NC_010660	GCC	2	6	599	604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734302
10	NC_010660	CAGTG	2	10	618	627	20 %	20 %	40 %	20 %	187734302
11	NC_010660	CAG	2	6	639	644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734302
12	NC_010660	TC	4	8	668	675	0 %	50 %	0 %	50 %	187734302
13	NC_010660	CAG	2	6	684	689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734302
14	NC_010660	CTTT	2	8	723	730	0 %	75 %	0 %	25 %	187734302
15	NC_010660	CAG	2	6	772	777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734302
16	NC_010660	AGC	2	6	873	878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734302
17	NC_010660	CGA	2	6	888	893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734302
18	NC_010660	ATC	2	6	950	955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734302
19	NC_010660	GAC	2	6	961	966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734302
20	NC_010660	GCG	2	6	968	973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734302
21	NC_010660	CCAT	2	8	975	982	25 %	25 %	0 %	50 %	187734302
22	NC_010660	GAT	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734512
23	NC_010660	ATA	2	6	1975	1980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734305
24	NC_010660	A	6	6	1989	1994	100 %	0 %	0 %	0 %	187734305
25	NC_010660	TCA	2	6	1996	2001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734305
26	NC_010660	AGC	2	6	2016	2021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734305
27	NC_010660	T	7	7	2027	2033	0 %	100 %	0 %	0 %	187734305
28	NC_010660	GA	3	6	2036	2041	50 %	0 %	50 %	0 %	187734305
29	NC_010660	ATG	2	6	2060	2065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734305
30	NC_010660	TCTA	2	8	2067	2074	25 %	50 %	0 %	25 %	187734305
31	NC_010660	ACA	2	6	2082	2087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734305
32	NC_010660	A	6	6	2141	2146	100 %	0 %	0 %	0 %	187734305
33	NC_010660	TAA	2	6	2204	2209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734305
34	NC_010660	ATG	3	9	2213	2221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734305
35	NC_010660	TGC	3	9	2232	2240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734305
36	NC_010660	A	7	7	2253	2259	100 %	0 %	0 %	0 %	187734305
37	NC_010660	TAA	2	6	2301	2306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734305
38	NC_010660	TCA	2	6	2340	2345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734305
39	NC_010660	ACAA	2	8	2376	2383	75 %	0 %	0 %	25 %	187734305
40	NC_010660	CTG	2	6	2489	2494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734305
41	NC_010660	TCTT	2	8	2499	2506	0 %	75 %	0 %	25 %	187734305
42	NC_010660	CT	3	6	2517	2522	0 %	50 %	0 %	50 %	187734305
43	NC_010660	T	7	7	2526	2532	0 %	100 %	0 %	0 %	187734305
44	NC_010660	A	7	7	2562	2568	100 %	0 %	0 %	0 %	187734305
45	NC_010660	CTG	2	6	2687	2692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734305
46	NC_010660	AAG	2	6	2712	2717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734305
47	NC_010660	TAT	2	6	2736	2741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734305
48	NC_010660	TAA	2	6	2742	2747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734305
49	NC_010660	TCT	2	6	3106	3111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734378
50	NC_010660	T	6	6	3111	3116	0 %	100 %	0 %	0 %	187734378
51	NC_010660	CAA	2	6	3182	3187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734378
52	NC_010660	CCG	2	6	3215	3220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734378
53	NC_010660	AGT	2	6	3238	3243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734378
54	NC_010660	CGCT	2	8	3278	3285	0 %	25 %	25 %	50 %	187734378
55	NC_010660	TAC	2	6	3326	3331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734378
56	NC_010660	GTT	2	6	3406	3411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734378
57	NC_010660	TAC	2	6	3420	3425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734378
58	NC_010660	TTAT	2	8	3489	3496	25 %	75 %	0 %	0 %	187734378
59	NC_010660	TTGG	2	8	3573	3580	0 %	50 %	50 %	0 %	187734378
60	NC_010660	GTT	2	6	3725	3730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734378
61	NC_010660	ATA	2	6	3741	3746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734378
62	NC_010660	A	6	6	3779	3784	100 %	0 %	0 %	0 %	187734378
63	NC_010660	GAA	2	6	3791	3796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734378
64	NC_010660	CAC	2	6	3909	3914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734482
65	NC_010660	GCAGAA	2	12	3968	3979	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	187734482
66	NC_010660	TTA	2	6	3985	3990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734482
67	NC_010660	TGC	2	6	3991	3996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734482
68	NC_010660	GAT	2	6	4007	4012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734482
69	NC_010660	TGT	2	6	4468	4473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734436
70	NC_010660	TCAGAT	2	12	4475	4486	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187734436
71	NC_010660	GCCA	2	8	4562	4569	25 %	0 %	25 %	50 %	187734436
72	NC_010660	CAG	2	6	4602	4607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734436
73	NC_010660	AGA	2	6	4612	4617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734436
74	NC_010660	TCC	2	6	4667	4672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734436
75	NC_010660	CAGC	2	8	4695	4702	25 %	0 %	25 %	50 %	187734436
76	NC_010660	ATCAC	2	10	4759	4768	40 %	20 %	0 %	40 %	187734436
77	NC_010660	T	6	6	4809	4814	0 %	100 %	0 %	0 %	187734436
78	NC_010660	CAC	2	6	5012	5017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734412
79	NC_010660	AGGA	2	8	5035	5042	50 %	0 %	50 %	0 %	187734412
80	NC_010660	ATGGAA	2	12	5049	5060	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187734412
81	NC_010660	CAT	2	6	5085	5090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734412
82	NC_010660	GCGA	2	8	5222	5229	25 %	0 %	50 %	25 %	187734319
83	NC_010660	TGC	2	6	5292	5297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734319
84	NC_010660	CT	3	6	5359	5364	0 %	50 %	0 %	50 %	187734319
85	NC_010660	CCG	2	6	5393	5398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734319
86	NC_010660	TTC	2	6	5401	5406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734319
87	NC_010660	CCACT	2	10	5478	5487	20 %	20 %	0 %	60 %	187734319
88	NC_010660	GAC	2	6	5491	5496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734319
89	NC_010660	GCG	2	6	5514	5519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734319
90	NC_010660	GCC	2	6	5565	5570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734319
91	NC_010660	CAGTG	2	10	5584	5593	20 %	20 %	40 %	20 %	187734319
92	NC_010660	CAG	2	6	5605	5610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734319
93	NC_010660	TC	4	8	5634	5641	0 %	50 %	0 %	50 %	187734319
94	NC_010660	CAG	2	6	5650	5655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734319
95	NC_010660	CTTT	2	8	5689	5696	0 %	75 %	0 %	25 %	187734319
96	NC_010660	CAG	2	6	5738	5743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734319
97	NC_010660	AGC	2	6	5839	5844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734319
98	NC_010660	CGA	2	6	5854	5859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734319
99	NC_010660	ATC	2	6	5916	5921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734319
100	NC_010660	GAC	2	6	5927	5932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734319
101	NC_010660	GCG	2	6	5934	5939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734319
102	NC_010660	CCAT	2	8	5941	5948	25 %	25 %	0 %	50 %	187734319
103	NC_010660	TG	3	6	7388	7393	0 %	50 %	50 %	0 %	187734373
104	NC_010660	TAG	2	6	7397	7402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734373
105	NC_010660	AAC	2	6	7448	7453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734373
106	NC_010660	GTT	2	6	7555	7560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734373
107	NC_010660	GCT	2	6	7580	7585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734373
108	NC_010660	GCT	2	6	7597	7602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734373
109	NC_010660	ACATC	2	10	7608	7617	40 %	20 %	0 %	40 %	187734373
110	NC_010660	CAC	3	9	7633	7641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734373
111	NC_010660	CCGG	2	8	7663	7670	0 %	0 %	50 %	50 %	187734373
112	NC_010660	G	6	6	7678	7683	0 %	0 %	100 %	0 %	187734373
113	NC_010660	TCC	2	6	7782	7787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734373
114	NC_010660	CCG	2	6	7823	7828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734373
115	NC_010660	CAG	2	6	8578	8583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734407
116	NC_010660	CTC	2	6	8595	8600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734407
117	NC_010660	CCGAA	2	10	8607	8616	40 %	0 %	20 %	40 %	187734407
118	NC_010660	CAGCC	2	10	8685	8694	20 %	0 %	20 %	60 %	187734407
119	NC_010660	ATC	2	6	8695	8700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734407
120	NC_010660	CAGC	2	8	8794	8801	25 %	0 %	25 %	50 %	187734407
121	NC_010660	CAG	2	6	8815	8820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734407
122	NC_010660	GCT	2	6	8853	8858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734407
123	NC_010660	CCG	2	6	8859	8864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734407
124	NC_010660	TCC	2	6	8921	8926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734407
125	NC_010660	CGG	2	6	8969	8974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734407
126	NC_010660	GGC	2	6	8989	8994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734407
127	NC_010660	GGAT	2	8	9086	9093	25 %	25 %	50 %	0 %	187734407
128	NC_010660	CCG	2	6	9126	9131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734407
129	NC_010660	GTC	2	6	9157	9162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734407
130	NC_010660	TCA	2	6	9233	9238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734407
131	NC_010660	GTCA	2	8	9253	9260	25 %	25 %	25 %	25 %	187734407
132	NC_010660	CTT	2	6	9279	9284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734407
133	NC_010660	GCA	2	6	9304	9309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734407
134	NC_010660	CAG	2	6	9328	9333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734407
135	NC_010660	GGC	2	6	9357	9362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734407
136	NC_010660	CAG	2	6	9427	9432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734407
137	NC_010660	CGG	2	6	9570	9575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734407
138	NC_010660	GCA	2	6	9616	9621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734407
139	NC_010660	GCA	2	6	9633	9638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734407
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142	NC_010660	CTTT	2	8	9746	9753	0 %	75 %	0 %	25 %	187734407
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151	NC_010660	GCC	2	6	10289	10294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734393
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247	NC_010660	TTG	2	6	15997	16002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734306
248	NC_010660	TAT	2	6	16036	16041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734306
249	NC_010660	TCTT	2	8	16052	16059	0 %	75 %	0 %	25 %	187734306
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251	NC_010660	T	6	6	16180	16185	0 %	100 %	0 %	0 %	187734306
252	NC_010660	TA	4	8	16188	16195	50 %	50 %	0 %	0 %	187734306
253	NC_010660	ATTG	2	8	17003	17010	25 %	50 %	25 %	0 %	187734323
254	NC_010660	T	6	6	17031	17036	0 %	100 %	0 %	0 %	187734323
255	NC_010660	CAC	2	6	17088	17093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734323
256	NC_010660	TCA	2	6	17694	17699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734318
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259	NC_010660	GAA	2	6	17951	17956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734290
260	NC_010660	CTGT	2	8	18006	18013	0 %	50 %	25 %	25 %	187734290
261	NC_010660	CTT	2	6	18092	18097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734290
262	NC_010660	TACT	2	8	18126	18133	25 %	50 %	0 %	25 %	187734290
263	NC_010660	GGT	2	6	18160	18165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734290
264	NC_010660	A	7	7	18166	18172	100 %	0 %	0 %	0 %	187734290
265	NC_010660	CGG	2	6	18179	18184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734290
266	NC_010660	CAGT	2	8	18194	18201	25 %	25 %	25 %	25 %	187734441
267	NC_010660	ACTG	2	8	18208	18215	25 %	25 %	25 %	25 %	187734441
268	NC_010660	CCCTTC	2	12	18275	18286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734441
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270	NC_010660	TCA	2	6	18371	18376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734441
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382	NC_010660	GCA	2	6	27918	27923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734442
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391	NC_010660	TC	4	8	28453	28460	0 %	50 %	0 %	50 %	187734510
392	NC_010660	CAGGAG	2	12	28468	28479	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	187734510
393	NC_010660	GTTCG	2	10	28486	28495	0 %	40 %	40 %	20 %	187734510
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397	NC_010660	TGG	2	6	28671	28676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734510
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399	NC_010660	TC	3	6	28796	28801	0 %	50 %	0 %	50 %	187734510
400	NC_010660	AAGGT	2	10	28835	28844	40 %	20 %	40 %	0 %	187734510
401	NC_010660	GCTG	2	8	28955	28962	0 %	25 %	50 %	25 %	187734510
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422	NC_010660	CAGA	2	8	29900	29907	50 %	0 %	25 %	25 %	187734374
423	NC_010660	GAA	2	6	30444	30449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734420
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